孔子博物馆位于曲阜城南北轴线大成路的正南端，与世界遗产三孔遥相呼应，由两院院士吴良镛先生规划设计，于2013年初正式动工，并于2013年底实现主馆封顶，即将建成投入使用。总建筑面积5.5万平方米，其中主馆4.2万平方米，东部平台1.3万平方米。主馆包括展陈面积1.7万平方米、文物库房面积7千平方米、文物修复中心面积1千平方米。该馆是具有时代标杆意义的重大文化工程，是孔子文化的集大成之所，是当代杰作，未来遗产。
孔子博物馆将拥有各类馆藏文物70多万件，闻名于世的藏品包括明代以来直至1948年的30多万件孔府私家文书档案、宋代以来4万多册善本古书、8000多件明清衣冠服饰以及大量的与祭祀孔子有关的礼乐器等，还有20多通著名的汉魏碑刻，是极具文化品位、代表中国传统文化精髓的综合类大型现代化博物馆。孔子博物馆建成后，将极大地改善原孔府馆藏文物的保护环境，充分地发挥馆藏文物的利用价值。